Secara administratif awalnya Desa
Sebong Lagoi termasuk kedalam wilayah kecamatan Bintan Utara kepulauan Riau,
dan Desa Sebong Lagoi merupakan Kampung Lagoi, nama ini berasal dari seorang
pedagang China Languek yang pertama kali singgah di pesisir pantai Banyantree
Kampung Baru Lagoi, dan pada tahun 1903 di pimpin oleh seorang Kepala Kampung
yang bernama Tok Said, setelah Tok Said wafat kepemimpinan di ganti oleh Tok
Pahiron atau lebih dikenal Gonggong pada tahun 1911 s/d 1921 beliau berasal
dari Dabo Singkep, kemudian kepemimpinan Tok Pahiron digantikan oleh Cik Samad
pada tahun 1921 s/d 1930 yang mana Beliau berasal dari pulau Penyengat, dengan
wafat nya Beliau kepemimpinan di gantikan oleh Putra nya yang bernama Cik Abas
dari tahun 1930 s/d 1941, kemudian digantikan dengan Cikgu Ahmad yang berasal
dari Trenggano Malaysia pada Tahun 1942 s/d 1955, dan setelah itu kepemimpinan
beliu di gantikan oleh Pak Oteh Dolan pada tahun 1956 s/d 1960 yang mana Beliau
juga berasal dari Trenggano Malaysia
Pada tahun 1961 s/d 1990
Kampung Lagoi dipimpin oleh Sak Idun atau yang lebih dikenal Tik Setin yang
berasal dari Dabo Singkep, namum dengan seiring terjadinya pemekaran wilayah
pada tahun 1991 nama Kampung Lagoi disahkan menjadi sebuah Desa yang bernama
Desa Sebong Lagoi yang dipimpin oleh seorang Penghulu ( Nama sebelum Kepala
Desa ) yang bernama Abu Bakar.S, yang tidak lain beliau adalah Putra dari Sak
Idun (Tik Setin), dan pada tahun 1993 Abu Bakar.S mengundurkan diri dan
digantikan oleh Syawal hingga tahun
1995, yang mana Syawal juga adalah
saudara Kandung dari Abu Bakar.S
Pada Tahun 1996 Desa
Sebong Lagoi mengadakan Pemilihan Kepala Desa, dan pemilihan tersebut
dimenangkan oleh Syamsuri Osman, dengan masa jabatan selama 6 tahun setelah
berakhirnya masa jabatan Beliau, roda pemerintahan Desa Sebong Lagoi di pimpin
oleh Asy’ari yang mana beliau bekerja sebagai seorang PNS dan ditunjuk sebagai
Pj Kepala desa Sebong Lagoi, pada tahun 2004 kemudian Beliau ikut mencalonkan
diri sebagai kepala desa, Pemilihan tersebut dimenangkan oleh Asy’ari dengan
masa jabatan selama 6 tahun. Seiring terjadinya pemekaran Kabupaten Kepulauan
Riau pada tahun 2008 akhirnya Sebong Lagoi terpisah dari Kecamatan Bintan Utara
dan ikut dalam Kecamatan Baru yang teridir dari 6 Desa dan 1 Kelurahan yaitu
Kecamatan Teluk Sebong Hingga saat ini.
Dan setelah berakhirnya masa jabatan Asy’ari
di gantikan oleh Roslan sebagai Kepala Desa Terpilih di tahun 2010. Dan pada
masa itu Sebong Lagoi menjadi Desa Baru yang dinamai Desa Persiapan Sebong
Lagoi yang merupakan embrio dalam membentuk Desa Baru di Kecamatan Teluk
Sebong, dengan seiring berjalan nya waktu pada tahun 2019 Sebong Lagoi di
pimpin kembali oleh Abu Bakar.S selama 2 ( Dua ) tahun, dan dengan pengunduran
beliau dimasa jabatan yang belum berakhir maka diadakan Pemilihan Antar Waktu
melanjutkan periode hingga 2024, dengan pemilihan tersebut terpilih lah Mazlan
sebagai Kepala Desa Sebong Lagoi hingga saat ini.
